Cijepni centar djeluje u sklopu Službe za zdravstvenu zaštitu djece od 0-6 godina.
Pri pregledu se utvrđuje zdravstveno stanje dojenčeta i odlučuje se o cijepljenju ili o potrebnoj terapiji. Roditeljima se objasni moguća reakcija na primljenu vakcinu i mjere koje treba poduzeti.
Cijepni centar vrši cijepljenje učenika završnih razreda osnovnih škola i završnih razreda srednjih škola odlaskom u školu. Cijepljenje se vrši prema kjlendaru cijepljenja koje donosi Federalno ministarstvo zdravstva. Centar radi redovito mjesečno i godišnje izvješće o cijepljenju i utrošenim vakcinama. Redovito se kontrolira cijepni status te se kontaktiraju roditelji djece o eventualno propuštenom cjepivu.